بررسی میزان بیان LncRNA CRNDE در بیماران ایرانی مبتلا به سرطان روده بزرگ

غلامی نژاد, ثریا; دیلمی, زهرا; صالح ‏زاده, علی; جلالی, امیر

doi:10.52547/JCT.11.4.293

نوع مقاله : علمی - پژوهشی

نویسندگان

¹ دانشگاه آزاد اسلامی، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، زنجان، ایران

² دانشگاه آزاد اسلامی، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، رشت، ایران

³ دانشگاه اراک، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، اراک، ایران

https://doi.org/10.52547/JCT.11.4.293

چکیده

هدف: هدف از این مطالعه مقایسه میزان بیان LncRNA CRNDE در نمونههای توموری و نرمال افراد مبتلا به سرطان روده بزرگ به‏روش Real Time-PCR بود.
مواد و روش‏ها: تعداد 20 نمونه از بافت توموری افراد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ و 20 نمونه بافت غیرتوموری همان افراد از بانک تومور مجتمع بیمارستانی امام خمینی دانشگاه علوم پزشکی تهران تهیه شد. پس از استخراج RNA کل از بافتهای سرطانی و نرمال، DNA مکمل سنتز و با استفاده از روش Real Time-PCR سطوح بیان LncRNA CRNDE در آنها مورد بررسی قرار گرفت. برای تجزیه و تحلیل آماری نتایج از روش ANOVA یک‏طرفه و تست Tukey استفاده شد.
نتایج: نتایج به‏دست آمده نشان‏دهنده افزایش دو برابری بیان LncRNA CRNDE در هر 20 نمونه سرطان روده بزرگ در مقایسه با نمونههای نرمال بود.
نتیجه‏گیری: باتوجه به‏افزایش قابل توجه بیان LncRNA CRNDE در سلولهای سرطانی نسبت به سلولهای نرمال، میتوان از حضور این LncRNA در خون به‏عنوان یک نشان‏گر زیستی برای تشخیص زودرس و غیرتهاجمی، سرطان روده بزرگ استفاده کرد.

تازه های تحقیق

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Investigation of Long Non-coding RNA CRNDE Expression in Iranian Patients with Colorectal cancer

نویسندگان [English]

S gholaminejad ¹
Z Deilami Khiabani ¹
A Salehzadeh ²
A Jalali ³

¹ Department of Biology, Faculty of Basic Science, Islamic Azad University, Zanjan, Iran

² Department of Biology, Faculty of Basic Science, Islamic Azad University, Rasht, Iran

³ Department of Biology, Faculty of Basic Science, Arak University, Arak, Iran

چکیده [English]

Aim: This study aimed to compare the expression levels of LncRNA CRNDE in malignant colorectal tumorsand adjacent normal tissues of patients by Real Time-PCR.
Material and Methods: 20 pairs of colorectal tumors and adjacent normal tissue specimens were prepared from the tumor bank of Imam Khomeini Hospital in Tehran University of Medical Sciences. After total RNA extraction from cancerous and normal tissues, cDNA was synthesized, and the expression levels of LncRNA CRNDE were examined using the Real Time-PCR method. A one-way analysis of variance (ANOVA) and Tukey's HSD test used for statistical analysis of results.
Results: The results showed a two-fold increase in LncRNA CRNDE expression in all 20 colorectal cancer samples compared with the normal cells.
Conclusion: According to the significant increase of the LncRNA CRNDE expression in cancer cells relative to normal cells and its presence in the bloodstream, this LncRNA maybe used as a non-invasive diagnostic biomarker for early detection of colorectal cancer.

کلیدواژه‌ها [English]

Long noncoding RNA
CRNDE
Colorectal cancer
Biomarker

اصل مقاله

مقدمه

سرطان شامل مجموعهای از بیماریهای ژنتیکی است که با رشد و تکثیر غیرقابل کنترل سلولها و انتشار آنها در بدن همراه است. براساس آخرین آمار جامع منتشر شده توسط سازمان بهداشت جهانی درباره میزان شیوع و مرگ‏ومیر ناشی از انواع سرطانها در سال 2018، سرطان روده بزرگ سومین سرطان شایع (1/6 درصد) و دومین عامل مرگ و میر ناشی از سرطان (2/9 درصد) در کل جهان بعد از سرطان ریه است. طبق برآوردهای انجام شده، در سال 2018 بیش از 8/1 میلیون نفر به‏سرطان روده بزرگ مبتلا و 881 هزار نفر بر اثر آن به‏مرگ دچار شدهاند (1). براساس این آمار میزان بروز سرطان روده بزرگ در کشورهای توسعه یافته در مقایسه با کشورهای درحال توسعه مانند ایران، حدود سه‏برابر بیش‏تر است که به‏نظر می‏رسد مهم‏ترین دلیل آن استفاده بیش‏تر این جوامع از غذاهای فرآوری شده و آماده نسبت به‏ غذاهای سنتی باشد.

درک اساس مولکولی سرطان نقش مهمی در شناسایی عوامل موثر در شکلگیری تومور و پیشرفت آن داشته و هم‏چنین پاسخ یا مقاومت بافت توموری در برابر عوامل ضدتوموری را تعیین می‏کند. ابتلا به‏سرطان روده بزرگ نتیجه وقوع برهم‏کنش بین مجموعه‏ای از عوامل ارثی، محیطی و فردی است. آشنایی با سرطان روده بزرگ در سطح مولکولی، اطلاعات لازم برای غربال‏گری افراد مستعد ابتلا به اشکال خانوادگی سرطان، امکان شناسایی شناساگرهای پیشبینی کننده به‏منظور تشخیص استعداد افراد نسبت به روشهای درمانی مختلف و هم‏چنین گسترش آزمایشهای تشخیص مولکولی غیرتهاجمی را فراهم کرده است. شناسایی عوامل مولکولی شرکت کننده در متاستاز سلولهای سرطانی روده بزرگ میتواند نقش مهمی در طراحی و تولید داروهای جدید برای جلوگیری از شکلگیری تومور و کنترل پیشرفت بیماری داشته باشد (2).

RNA ی غیرکدکننده طویل (lncRNAs) رونوشتهای با طول بیش‏تر از 200 نوکلئوتید با عدم‏قابلیت کدکردن پروتئینها هستند که در تنظیم بیان ژنها در سطوح رونویسی و ترجمه و هم‏چنین تغییرات اپیژنتیک نقشهای مختلفی ایفا میکنند (3). اختلال در عمل‏کرد یا بیان lncRNAها ارتباط نزدیکی با ابتلا به‏انواع بیماریها از جمله سرطان دارد (4). مشخص شده است که این رونوشتهای بلند غیرکدکننده که در سرطانهای مختلف پروفایلهای منحصر به‏فردی دارند، در مهار مرگ برنامهریزی شده، تکثیر، مهاجرت و تهاجم سلولهای سرطانی به‏بافتهای دیگر شرکت دارند (5، 6). lncRNAها مانند سایر قطعات نوکلئیک اسید مرتبط با سرطان که از سلولها خارج شدهاند، به‏داخل جریان خون بیماران مبتلا به‏سرطان وارد شده و امکان ارزیابی غیرتهاجمی بیان ژنها را فراهم می‏کنند. به‏همین علت از این رونوشتهای غیرکدکننده میتوان به‏عنوان نشان‏گر زیستی برای پیش آگهی و تشخیص سرطان استفاده کرد. مطالعات اخیر نشان داده است که بیان lncRNAها در بعضی از تومورهای انسانی ازجمله سرطان روده بزرگ (CRC) به‏میزان زیادی افزایش یافته یا مهار میشد (7).

رونوشتهای غیرکدکننده CRNDE (colorectal neoplasia differentially expressed) ازجمله lncRNAهای سلولهای انسان است که ژن کدکننده آن برروی بازوی بزرگ کروموزوم 16 انسان (16q12.2) قرار گرفته است. نتایج حاصل از تحقیقات گذشته، نشان داده است که CRNDE نقش قابل توجهی در تکثیر، مهاجرت و تهاجم انواع سلولهای توموری دارد. Wang و همکاران در سال 2015 بیان بیش از اندازه CRNDE در سلولهای گلیوما را گزارش کردند که نتیجه آن ممکن است تسهیل رشد و مهاجرت این سلولها درشرایط in vivo و in vitro باشد (8). همچنین Chen و همکاران (9) مشاهده کردند که افزایش CRNDE از راه تاثیر منفی برروی تنظیم mirRNA-384 باعث بیان بیش‏تر فاکتور هستهای κB و p پروتئین کیناز B (AKT) و در نتیجه تحریک تکثیر، مهاجرت و تهاجم کارسینوم کبدی میشود. Zhu و همکاران (10) به ‏بررسی نقش LncRNA CRNDE برروی تکثیر و تهاجم سلولهای کارسینوم سلولهای کبدی در شرایط in vivo و in vitro پرداختند. آنها در بررسیهای خود نشان دادند که کاهش بیان CRNDE باعث افزایش بیان پروتئینهای کادهرین E و ZO-1 و کاهش بیان کادهرین N، slug، twist و vimentin میشود که نتیجه آن مهار انتقال اپیتلیال-مزانشیمی است. نقش CRNDE در شروع و پیشرفت سرطان روده بزرگ نیز توسط محققین مختلف اثبات شده است. در سال 2016، Liu و همکاران (11) گزارش کردند که یک ارتباط معنیدار بین افزایش بیان LncRNA CRNDE-h که یکی از اشکال CRNDE است با شکل‏گیری و پیشرفت سرطان روده بزرگ وجود دارد. براساس گزارش Ding و همکاران (12)، غیرفعال کردن این رونوشت غیرکدکننده منجر به‏مهار تکثیر سلولهای سرطانی روده بزرگ و القای مرگ برنامهریزی شده در آنها در هردو حالت in vivo و in vitro میشد که نتیجه آن کاهش اندازه تومور است.

باوجود پیشرفت در روشهای تشخیص، بیش از نیمی از بیماران مبتلا به‏سرطان روده بزرگ تسلیم بیماری میشوند که دلیل آن تشخیص بیماری در مراحل پیشرفته است. به‏همین دلیل با توجه به‏کمبود روشهای پیش آگهی و تشخیصی غیرتهاجمی و کم‏ هزینه برای CRC، شناسایی نشانگرهای زیستی جدید و بالقوه موثر در تحقیقات اخیر سرطان توجه بیش‏تری را به‏خود جلب کرده است. با توجه به‏آمار بالای ابتلا و مرگ‏ومیر ناشی از سرطان روده بزرگ و نقش مهم CRNDE در شکلگیری و پیشرفت این سرطان و از آنجا که تاکنون تحقیقی برروی ارتباط سطوح بیان CRNDE و استعداد ابتلا به‏سرطان روده بزرگ در جمعیتهای ایرانی صورت نگرفته، در این تحقیق به‏مطالعه سطح بیان LncRNA CRNDE در یک جمعیت از افراد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ پرداخته شد.

مواد و روش‌ها

جمع‏آوری نمونه: در این تحقیق به‏منظور بررسی تغییرات بیانی ژن کدکننده LncRNA CRNDE، تعداد 20 نمونه بافت توموری تازه جدا شده از افراد مبتلا به‏مراحل مختلف سرطان روده بزرگ از بانک تومور مجتمع بیمارستانی امام خمینی دانشگاه علوم پزشکی تهران تهیه شد. از بین بیماران انتخاب شده که هیچ‏کدام پیش از آن تحت درمانهای مختلف مانند شیمی یا پرتو درمانی قرار نگرفته بودند، 10 مورد به‏درجات 1 و 2 بیماری و 10 مورد دیگر به‏درجات 3 و 4 مبتلا بودند. درکنار هر نمونه توموری، یک نمونه از بافت سالم مجاور فرد بیمار نیز به‏عنوان نمونه کنترل جمع‏آوری شد. تمام افرادی که از نمونههای بافت ایشان در این پژوهش استفاده شده، طبق فرم اجازهنامه کتبی بیمارستان امام خمینی، رضایت خود را جهت انجام پژوهش اعلام کردند.

بررسی بیان ژن

استخراج RNA: برای استخراج RNA کل سلول از کیت RiboEX (GeneAll Biotechnology RNA extraction kit, South Korea) و طبق دستورالعمل شرکت سازنده استفاده شد. برای اطمینان از استخراج صحیح RNA، نمونهها روی ژل آگارز 2 درصد بررسی و به‏منظور حذف آلودگیهای DNA، به‏مدت 30 دقیقه در دمای 37 درجه سانتیگراد با 2 میکرولیتر آنزیم DNaseI (TaKaRa bio, Japan) تیمار شدند. در پایان برای غیرفعال کردن آنزیم DNaseI، نمونههای RNA به‏مدت 60 دقیقه با 2 میکرولیتر EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid) تیمار و کمیت و کیفیت آنها، باروش تعیین دانسیته نوری به‏وسیله دستگاه نانودراپ (Thermo scientific-Nanodrop 2000) تعیین شد.

طراحی آغازگر و سنتز cDNA: میزان بیان ژن کدکننده LncRNA CRNDE باروش Real Time-PCR مورد بررسی قرارگرفت. برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مورد نیاز جهت سنتز توالی cDNA از نرمافزار generunner و برای بررسی اختصاصیت آنها از نرم افزار primerblast در پایگاه داده NCBI استفاده شد (جدول 1). سنتز cDNA با کیت BioFact (South Korea) انجام شد. برای این منظور به‏وسیله دستگاه نانودراپ غلظت 1000 نانوگرم در میلی‏لیتر از هر نمونه تهیه و cDNA طبق دستورالعمل شرکت سازنده سنتز شد. مخلوط واکنش Real Time-PCR با حجم کلی 20 میکرولیتر شامل 6 میکرولیتر مخلوط سایبرگرین (TaKaRa bio, Japan)، 2 میکرولیتر cDNA (با غلظت 100 نانوگرم در میکرولیتر)، 10 پیکومول مخلوط آغازگرهای رفت و برگشت و 12 میکرولیتر آب عاری از نوکلئاز، تهیه و واکنش زنجیرهای پلیمراز در 40 چرخه، مطابق برنامه زمانی-دمایی جدول 2 به‏وسیله دستگاه ترمال سایکلر (Eppendorf Master Cycler Gradient, Germany) انجام شد. به‏منظور مقایسه و بررسی درستی بیان ژن هدف، از GAPDH (Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase) به‏عنوان ژن مرجع استفاده شد (13). پس از پایان مراحل واکنش زنجیرهای پلیمراز، منحنیهای ذوب بین دماهای 60 تا 64 درجهسانتیگراد به‏منظور بررسی اختصاصیت واکنش و عدم تشکیل دایمرهای آغازگر رسم شد.

جدول 1: توالی آغازگرهای مورد استفاده

آغازگر	توالی	طول محصول (bp)
CRNDE-F	5'-ACACGGCTTTCCGGAGTAGA-3'	bp 118
CRNDE-R	5'-GCCAACATTTGGAGGAACCC-3'
GAPDH-F	5'-ATGTTGCAACCGGGAAGGAA-3'	bp 159
GAPDH-R	5'-AGGAAAAGCATCACCCGGAG-3'

جدول 2: برنامه زمانی و دمایی واکنش Real Time-PCR

مرحله	زمان	دما (درجه سانتیگراد)	تعداد چرخه
واسرشت اولیه	10 دقیقه	95	1
واسرشت	30 ثانیه	94	40
اتصال مجدد	30 ثانیه	60
طویل شدن	20 ثانیه	72

آنالیز آماری

تجزیه و تحلیل آماری دادههای به‏دست آمده از واکنش Real Time-PCR با استفاده از نرم افزار SPSS نسخه 23 انجام شد. بیان ژن LncRNA CRNDE در نمونهها باروش Tukey's HSD post-hoc محاسبه و برای بررسی توزیع نرمال بودن داده‏ها از آزمون ANOVA یک‏طرفه استفاده و متوسط متغیرها با استفاده از میانگین±انحراف معیار بیان شد. رسم نمودارها در ‌Excel 2016 انجام شد. هر آزمایش حداقل سه‏بار تکرار و 05/0p< برای سطح اختلاف معنی‌داری بین گروهها درنظر گرفته شد.

نتایج

در این مطالعه به‏بررسی میزان بیان ژن کدکننده LncRNA CRNDE در 20 نمونه از بافت توموری و 20 نمونه از بافت سالم افراد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ، به‏روش Real Time-PCR پرداخته شد. منحنی ذوب رسم شده برای ژن هدف دارای یک قله بود که نشان دهنده تکثیر تنها یک محصول خاص در واکنش PCR است (نمودار 1).

نمودار1: نمودار منحنی ذوب LncRNA CRNDE با نقطه ذوب 9/82 درجهسانتیگراد

در زمان انجام واکنش، دستگاه Real Time-PCR میزان تغییرات نور فلورسنت در هر چرخه را به‏صورت یک منحنی تکثیر نشان داد (نمودار 2)، به‏این ترتیب که با افزایش میزان محصول تولید شده، میزان رنگ متصل شده بین دو رشته DNA بیشتر و در نتیجه میزان نور فلورسنت ساطع شده نیز بیش‏تر خواهد شد. برای منحنی تکثیر همه نمونهها یک حد آستانه در فاز نمایی تعریف شد و یک Ct به‏دست آمد که نشان دهنده چرخهای است که در آن شدت نور فلورسانت ساطع شده از تکثیر محصول به‏حد آستانه رسیده است.

نمودار2: منحنی تکثیر LncRNA CRNDE

بررسی بیان LncRNA CRNDE در نمونههای توموری در مقایسه با نمونههای نرمال، نشان دهنده افزایش بیان در سلولهای هر 20 فرد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ بود. این افزایش به‏طور میانگین حدود دو برابر و در سطح 1000/0 معنیدار بود (شکل 1).

شکل1: مقایسه میانگین بیان ژن LncRNA CRNDE در 20 نمونه توموری و بافت نرمال مجاور آن (0001/0p<، 3=n)

بحث

RNAهای غیرکدکننده طویل (LncRNAs) گروهی از miRNAها هستند که با هدف قرار دادن توالیهای غیرکدکننده سمت ʹ3 ژنهای هدف خود، بیان آنها را تنظیم میکنند (14، 15). مطالعات گذشته نشان داده است که فعالیت حدود 18 درصد از ژن‏های غیرکدکننده lncRNAها با انواع سرطانها مرتبط است، درحالی‏که تنها 9 درصد از ژنهای کدکننده پروتئینهای انسانی در ارتباط با سرطانهای مختلف هستند (16). شواهد نشان میدهد که تغییر بیان lncRNAها با شکلگیری تومور همراه است (71).

در سال های اخیر مشخص شده است که بیان بیقاعده بعضی از lncRNA ها نقش مهمی در شکلگیری و پیشرفت سرطان روده بزرگ ایفا میکند. به‏عنوان مثال مشخص شده است که افزایش بیان lncRNAهای CCAT1، MALAT1، PVT-1 و HOTAIR در سلولهای سرطان روده بزرگ میتواند نقش مهمی در شکلگیری تومور و متاستاز آن به‏بافتهای دیگر داشته باشد (81-12). Cui و همکاران (22) نشان دادند که lncRNA HEIH با تغییر عمل‏کرد miR-939/Bcl-xL باعث افزایش تکثیر سلولهای تومور روده بزرگ میشود. Iguchi و همکاران (23) ثابت کردند که lncRNA ATB به‏طور مشخصی با رشد سلول‏های تومور روده بزرگ و رگزایی در بافت سرطانی ارتباط دارد. Xu و همکاران(24) تایید کردند که کاهش سطوح lncRNA SNHG1 در سلولهای سرطان روده بزرگ، از راه تنظیم miR-154-5p باعث مهار رشد سلولهای سرطانی میشد. با اینحال بیان lncRNAها در سلولهای سرطان روده بزرگ همواره با افزایش همراه نیست، مطالعات نشان داده است که کاهش بیان lncRNAهای Evf-2 و GAS5 در این سلولها میتواند عامل جلوگیری از پیشرفت چرخه سلولی و آغاز مرگ برنامهریزی شده در سلولهای سرطان روده بزرگ باشد (25 و 26).

در این مطالعه میزان بیان ژن LncRNA CRNDE در سلولهای بافت سرطانی و بافت نرمال مجاور آن در 20 فرد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ مورد ارزیابی و مقایسه قرار گرفت. نتایج به‏دست آمده نشان دهنده افزایش معنی‏دار و قابل توجه LncRNA CRNDE در هر 20 فرد مورد مطالعه در بافت توموری نسبت به بافت نرمال بود. این نتایج، تحقیقات Ding و همکاران (12) که نشان دادند LncRNA CRNDE از طریق مهار بیان DUSP5/CDKN1A باعث تکثیر سلولهای توموری روده بزرگ میشود، را تایید میکند. افزایش بیان LncRNA CRNDE و ارتباط آن با تکثیر و متاستاز سلولهای سرطانی و مهار مرگ برنامه‏ریزی شده در مطالعات دیگر نیز گزارش شده است. به‏عنوان مثال، Tang و همکاران نشان دادند که این LncRNA از راه افزایش بیان SIX1 در پیشرفت کارسینوم سلولهای کبدی نقش دارد (27). Zhu و همکاران (10) نشان دادند LncRNA CRNDE با افزایش مسیر سیگنالینگ Wnt/beta-catenin در شکلگیری کارسینوم سلولهای کبدی شرکت میکند. آنها هم‏چنین تایید کردند که این LncRNA به‏واسطه miR-136-5P باعث افزایش بیان IRX5 و تحریک تشکیل سلولهای سرطانی میشود (28). علاوه براین، غیرفعال شدن ژن کدکننده LncRNA CRNDE ممکن است با افزایش مرگ برنامهریزی شده سلولهای سرطانی روده بزرگ در شرایط in vitroو in vivoهمراه باشد (12). Han و همکاران (29) مشاهده کردند که غیرفعال شدن این LncRNA و miR-181a-5p microRNA باعث مهار مسیر سیگنالینگ Wnt/β-catenin و در نتیجه مهار تکثیر سلولهای سرطانی و کاهش مقاومت آنها در برابر داروهای شیمی درمانی میشد. بنابراین شاید بتوان از آن به‏عنوان یک مارکر پیش‏ آگهی‏دهنده در این سرطان استفاده کرد.

نتیجهگیری

بررسی سطوح بیان LncRNA CRNDE در نمونههای توموری و نرمال افراد مبتلا به‏سرطان روده بزرگ با استفاده از روش Real Time-PCR نشان داد که تفاوت قابل ملاحظهای بین میزان بیان این LncRNA در دو گروه سلولی وجود دارد. بنابراین شاید بتوان از اندازهگیری مقادیر این LncRNA در خون محیطی افراد مستعد یا مشکوک به ابتلا به‏سرطان روده بزرگ به‏عنوان یک روش غیرتهاجمی برای تشخیص زود هنگام بیماری استفاده کرد.

تشکر و قدردانی

از مدیریت مرکز تومور بیمارستان امام خمینی تهران به‏دلیل در اختیار گذاشتن نمونههای توموری تشکر و قدرانی میشود.

مراجع

1. Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, et al. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. Cancer Journal for Clinicians. 2018; 68(6): 394.

2. Munteanu I, Mastalier B. Genetics of colorectal cancer. Journal of Medicine and Life. 2014; 7(4): 507-511.

3.Iyer MK, Niknafs YS, Malik R, Singhal U, et al. The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome. Nature genetics. 2015; 47(3): 199–208.

4. Jiang MC, Ni JJ, Cui WY, Wang BY, et al. Emerging roles of lncRNA in cancer and therapeutic opportunities. American Journal of Cancer Research. 2019; 9(7): 1354-1366.

5. Batista PJ, Chang HY. Long noncoding RNAs: cellular address codes in development and disease. Cell. 2013; 152(6): 1298–1307.

6. Yuan JH, Yang F, Wang F, Ma JZ, et al. A long noncoding RNA activated by TGF-beta promotes the invasion-metastasis cascade in hepatocellular carcinoma. Cancer Cell. 2014; 25(5): 666–681.

7. Siddiqui H, Al-Ghafari A, Choudhry H, Al Doghaither H. Roles of long non-coding RNAs in colorectal cancer tumorigenesis: A Review. Molecular and Clinical Oncology. 2019; 11(2): 167-172.

8. Wang Y, Wang Y, Li J, Zhang Y, et al. CRNDE, a long-noncoding RNA, promotes glioma cell growth and invasion through mTOR signaling. Cancer Letter. 2015; 367(2): 122–128.

9. Chen Z, Yu C, Zhan L, Pan Y, et al. LncRNA CRNDE promotes hepatic carcinoma cell proliferation, migration and invasion by suppressing miR-384. American Journal of Cancer Research. 2016; 6(10): 2299–2309.

10. Zhu L, Yang N, Du G, Li C, et al. LncRNA CRNDE promotes the epithelial-mesenchymal transition of hepatocellular carcinoma cells via enhancing the Wnt/β-catenin signaling pathway. Journal of Cellular Biochemistry. 2018; 120(2): 1156–64.

11. Liu T, Zhang X, Yang YM, Du LT, et al. Increased expression of the long noncoding RNA CRNDE-h indicates a poor prognosis in colorectal cancer, and is positively correlated with IRX5 mRNA expression. OncoTargets and Therapy. 2016; 11(9): 1437–1448.

12. Ding J, Li J, Wang H, Tian Y, et al. Long noncoding RNA CRNDE promotes colorectal cancer cell proliferation via epigenetically silencing DUSP5/CDKN1A expression. Cell Death and Disease. 2017; 8: e2997.

13. Li DX, Fei XR, Dong YF, Cheng CD, et al. The long non-coding RNA CRNDE acts as a ceRNA and promotes glioma malignancy by preventing miR-136-5p-mediated downregulation of Bcl-2 and Wnt2. Oncotarget. 2017; 8(50): 88163-88178.

14. Doench JG, Sharp PA. Specificity of microRNA target selection in translational repression. Genes & Development. 2004; 18(5): 504–511.

15. Chen Z, Pan X, Sheng Z, Yan G, et al. Baicalin suppresses the proliferation and migration of Ox-LDL-VSMCs in atherosclerosis through upregulating miR-126-5p. Biological and Pharmaceutical Bulletin. 2019; 42(9): 1517–1523.

16. Khachane AN, Harrison PM. Mining mammalian transcript data for functional long non-coding RNAs. PloS One. 2010; 5(4): e10316.

17. Oliva J, Bardag-Gorce F, French BA, Li J, et al. The regulation of non-coding RNA expression in the liver of mice fed DDC. Experimental and MolecularPathology. 2009; 87(1): 12–19.

18. Nissan A, Stojadinovic A, Mitrani-Rosenbaum S, Halle D, et al. Colon cancer associated transcript-1: a novel RNA expressed in malignant and pre-malignant human tissues. International Journal of Cancer. 2012; 130(7): 1598–1606.

19. Takahashi Y, Sawada G, Kurashige J, Uchi R, et al. Amplification of PVT-1 is involved in poor prognosis via apoptosis inhibition in colorectal cancers. British Journal of Cancer. 2014; 110(1): 164–171.

20. Xue Y, Gu D, Ma G, Zho l, et al. Genetic variants in lncRNA HOTAIR are associated with risk of colorectal cancer. Mutagenesis. 2015; 30(2): 303–310.

21. Zheng HT, Shi DB, Wang YW, Li XX, et al. High expression of lncRNA MALAT1 suggests a biomarker of poor prognosis in colorectal cancer. International Journal of Clinical and Experimental Pathology. 2014; 7(6): 3174–3181.

22. Cui C, Zhai D, Cai L, Duan Q, et al. Long noncoding RNA HEIH promotes colorectal cancer tumorigenesis via counteracting miR-939Mediated transcriptional repression of Bcl-xL. CancerResearch and Treatment. 2018; 50(3): 992–1008.

23. Iguchi T, Uchi R, Nambara S, Saito T, et al. A long noncoding RNA, lncRNA-ATB, is involved in the progression and prognosis of colorectal cancer. Anticancer Research. 2015; 35(3): 1385–1388.

24. Xu M, Chen X, Lin K, Zeng K, et al. The long noncoding RNA SNHG1 regulates colorectal cancer cell growth through interactions with EZH2 and miR-154-5p. Molecular Cancer. 2018; 17(1): 141.

25. Berghoff EG, Clark MF, Chen S, Cajigas I, et al. Evf2 (Dlx6as) lncRNA regulates ultraconserved enhancer methylation and the differential transcriptional control of adjacent genes. Development. 2013; 140(21): 4407–4416.

26. Yin D, He X, Zhang E, Kong R, et al. Long noncoding RNA GAS5 affects cell proliferation and predicts a poor prognosis in patients with colorectal cancer. Medical Oncology. 2014; 31(11): 253.

27. Tang D, Zhao L, Peng C, Ran K, et al. LncRNA CRNDE promotes hepatocellular carcinoma progression by upregulating SIX1 through modulating miR-337-3p. Journal of Cellular Biochemistry. 2019; 120(9): 16128–16142.

28. Zhu L, Liu Y, Chen Q, Yu G, et al. Long-noncoding RNA colorectal neoplasia differentially expressed gene as a potential target to upregulate the expression of IRX5 by miR-136-5P to promote oncogenic properties in hepatocellular carcinoma. Cellular Physiology and Biochemistry. 2018; 50(6): 2229–2248.

29. Han P, Li JW, Zhang BM, Lv JC, et al. The lncRNA CRNDE promotes colorectal cancer cell proliferation and chemoresistance via miR-181a-5p-mediated regulation of Wnt/β-catenin signaling. Molecular Cancer. 2017; 16(9):1-13.

سلول و بافت

بررسی میزان بیان LncRNA CRNDE در بیماران ایرانی مبتلا به سرطان روده بزرگ

اصل مقاله

اصل مقاله

مراجع

مراجع

دوره 11، شماره 4
اسفند 1399
صفحه 293-301

بررسی میزان بیان LncRNA CRNDE در بیماران ایرانی مبتلا به سرطان روده بزرگ

اصل مقاله

اصل مقاله

مراجع

مراجع

دوره 11، شماره 4اسفند 1399صفحه 293-301

دوره 11، شماره 4
اسفند 1399
صفحه 293-301