بررسی میزان بیانmiR-223-3p، FOXO1 و TP53در بیماران مبتلا به آندومتریوز تخمدانی
دوره 16، شماره 3، پاییز 1404، صفحه 291-308
https://doi.org/10.61882/JCT.16.3.291
سمیه شعبانی چلکاسری، فرهاد مشایخی، زیبا ظهیری، زیور صالحی
چکیده هدف: هدف از این تحقیق، بررسی بیان miR-223-3p و ژنهای هدف FOXO1 و TP53در آندومتریوز تخمدانی از طریق تحلیل بیوانفورماتیکی و تایید تجربی میباشد. مواد و روشها: پروفایلهای بیان ژن، از مجموعه داده سری GSE105765 از پایگاه داده Gene Expression Omnibus (GEO) استخراج شد. ژنهای بیان شده با استفاده از بسته "limma" در نرمافزار R شناسایی و نمودار نقشه حرارتی برای ژنهای با بیان متفاوت رسم و در نهایت miR-223-3p برای این تحقیق انتخاب شد. سپس ژنهای FOXO1 و TP53 نیز بهعنوان ژنهای هدف miR-223-3p با استفاده از پایگاه داده miRDB انتخاب شدند. در بخش تجربی مجموعا 40 نمونه بافت نابهجا (اکتوپیک)، 40 نمونه بافت یوتوپیک از بیماران مبتلا به آندومتریوز و 40 نمونه آندومتر طبیعی بهعنوان گروه کنترل مطالعه شد. پس از استخراج RNA کل و سنتز cDNA، میزان بیان miR-223-3p، FOXO1 و TP53 توسط Real Time PCR بررسی شد. نتایج: نتایج نشان داد که افزایش معنیداری در بیان miR-223-3p در نمونه های بافتی اکتوپیک نسبت به یوتوپیک و کنترل وجود دارد. همچنین کاهش معنیداری در بیان ژنهای FOXO1 و TP53در گروه اکتوپیک نسبت به گروههای یوتوپیک و کنترل مشاهده شد. در حالیکه اختلاف معنیداری در بیان miR-223-3p، FOXO1 و TP53در بین گروه یوتوپیک و کنترل مشاهده نشد. نتیجهگیری: نتیجهگیری می شود که بیان miR-223-3p، FOXO1 و TP53 در بافت آندومتر اکتوپیک بیماران مبتلا به آندومتریوز تغییر میکند. همچنین پیشنهاد میشود که miR-223-3p، FOXO1 و TP53 ممکن است کاندیدا برای پاتوژنز آندومتریوز و پتانسیل درمانی آنها در آندومتریوز باشد.
توالییابی ژن همساخت LEAFY در روپاس (Solanum villosum Mill.)
دوره 6، شماره 1، بهار 1394، صفحه 51-58
https://doi.org/10.52547/JCT.6.1.51
محسن اسدی خانوکی، فرخنده رضانژاد، غلامرضا شریفی سیرچی، حسینعلی ساسان
چکیده هدف: هدف از این تحقیق شناسایی همساخت این ژن در گونهای تاجریزی بهنام روپاس (Solanum villosum Mill.) است.
مواد و روشها: RNA کل از مریستم راس شاخساره استخراج و برای ساخت cDNA استفاده گردید. آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی ژنهای همساخت LEAFY در سایر گیاهان هم جنس و هم خانواده، طراحی و از آنها در واکنش RT-PCR استفاده گردید. محصول RT-PCR پس از خالص سازی، توالی یابی گردید.
نتایج: نتایج نشان دهنده تکثیر قطعه مورد نظر از ژن بهطول 540 نوکلئوتید بود که SvLFY نامگذاری شد. مقایسه توالی پروتئین استنباطی SvLFY، با پروتئینهای همساخت LEAFY در سایر گیاهان نشان دهنده شباهت زیاد این قطعه با ناحیه C ترمینال آن پروتئینها بود.
نتیجه گیری: این نتایج نشان میدهد که بهاحتمال SvLFY نیز همانند LEAFY در نمو گل نقش دارد و میتواند بهعنوان ژن تعیین هویت مریستم گل در روپاس عمل کند.
