بیان ژن آنزیم بنزیل فورمات دکربوکسیلاز در باکتری E.coli
دوره 16، شماره 2، تابستان 1404، صفحه 113-131
https://doi.org/10.61882/JCT.16.2.113
مولود خیری، علی اصغر دلدار، محمدجواد دهقانعصمت آبادی، نفیسه پورمهدی
چکیده هدف: 1،2،4-بوتان تریول (BT)، یک ماده شیمیایی غیرطبیعی با کاربردهای دارویی و نظامی، از ویژگیهای این ماده است. تولید زیستی BT هدف این تحقیق است، زیرا روش شیمیایی بهدلیل محدودیتهای کاتالیزوری و بازده پایین، اقتصادی نیست. تولید آنزیم بنزیل فورمات دکربوکسیلازبا هدف تکمیل مسیر آنزیمی سنتز زیستی BT میباشد که از زایلوز طی چهار واکنش آنزیمی انجام میشود و E. coli با دارا بودن دو آنزیم از این مسیر، با افزودن دو ژن دیگر، قادر به تکمیل آن خواهد بود. مواد و روشها: بهمنظور ساخت سویه E. coli بیانکننده آنزیم بنزوئیل فرمات دکربوکسیلاز، ژن mdlC از P. putida تکثیر و در وکتورهای pBAD و pET28 کلون شد. پس از تایید کلونینگ با آزمایشهای تاییدی، بیان پروتئین با ژل SDS-PAGE و عملکرد آنزیم مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: پس از انتقال سازواره بیانی به سویه مناسب، حضور باند پروتئینی 56 کیلودالتونی در ژل SDS-PAGE، بیان ژن mdlC را تایید کرد. برای ارزیابی عملکرد آنزیم، وکتور نوترکیب pBAD.mdlC به سویه TOP10 ترنسفرم و تولید BT در محیط کشت با روش HPLC آنالیز شد. نتیجهگیری: بنزوئیل فرمات دکربوکسیلاز (BFD)، آنزیمی کلیدی در مسیر تولید بوتان تریول (BT) درE. coli است. در این مطالعه، ژن mdlC کد کننده BFD از P. putida تکثیر و در وکتورهای pBAD و pET28 کلون شد. سیستم بیانی pET28 بهدلیل سهولت استفاده انتخاب شد و وکتور pBAD نیز بهدلیل قابلیت القا مورد استفاده قرار گرفت. بیان پروتئین 56 کیلودالتونی با SDS-PAGE تایید و عملکرد آنزیم در تولید BT با HPLC بررسی شد.
کلون سازی و بیان ژن آنزیم زایلونات دهیدراتاز از کلوباکتر ویبریوئیدس
دوره 15، شماره 3، پاییز 1403، صفحه 203-214
https://doi.org/10.61186/JCT.15.3.203
فاطمه مرتمی، محمدجواد دهقان عصمت آبادی، علی اصغر دلدار، رضا محمدی، نفیسه پورمهدی، فاطمه بزرگمهر
چکیده کلون سازی و بیان ژن آنزیم زایلونات دهیدراتاز از کلوباکتر ویبریوئیدس
کلون و بیان ژن نوترکیب هومون رشد با استفاده از برچسب تیوردوکسین
دوره 7، شماره 4، زمستان 1395، صفحه 399-405
https://doi.org/10.52547/JCT.7.4.399
حمیده روحانی نژاد، ساناز یاری، علی اصغر دلدار، امیر اشکان حمیدی
چکیده هدف: در قرن حاضر، تولید داروهای نوترکیب افزایش یافته است. از جمله این داروها، هورمون رشد میباشد که بهعلت مشکلاتی که در پروسهی بیان نوع سیتوپلاسمی و پری پلاسمی این پروتئین وجود دارد، یافتن راه حلی که بتواند بیان را بهینه نماید ضروری بهنظر میرسد. لذا در این تحقیق با استفاده نمودن از trx-tag بیان هورمون رشد را بهصورت محلول بهینه شد که علاوه بر افزایش بیان پرتئین (حل مشکل پری پلاسمی) از تشکیل انکلوزیون بادی (مشکل سیتوپلاسمی) جلوگیری مینماید.
مواد و روشها: سنتز ژن و کاست ژنی بهمنظور بیان هورمون رشد در سیستم بیانی pET 32a صورت گرفت. کاست ژنی شاملtrx-tag برای محلول سازی پروتئین،His tag بهمنظور خالص سازی و انتروکیناز در ابتدای ژن rHgh بهمنظور جداسازی برچسب های قبلی از این پروتئین میباشد.
نتایج: بعد از کلون سازی این ژن در وکتور و بیان آن، تایید آن توسط وسترن بلات صورت گرفت. نتایج بهدست آمده با استفاده از نرم افزارهای آنالیز ژل درصد بیانی حدود از کل بیان را در سویه نوترکیب نشان میدهد.
نتیجه گیری: در این تحقیق، نشان داده شد که با استفاده از Trx-tag میتوان پروتئین را بهحالت محلول در آورد و میزان بیان را بالا برد در ادامه با انجام مراحل تخمیر و پایین دستی میتوان به نتایج بهتری دست یافت.
کلون سازی و بیان ژن میدکاین نوترکیب انسانی در اشریشیاکولای سویهی اوریگامی
دوره 6، شماره 2، تابستان 1394، صفحه 143-151
https://doi.org/10.52547/JCT.6.2.143
سعادت الله غفاری، علی اصغر دلدار، علی بهرامی، عمران اسماعیل زاده، بهارک مهیاد، فاطمه روح الله
چکیده هدف: هدف این پژوهش کلون سازی و بیان ژن کد کنندهی میدکاین انسانی در اشریشیاکولای بوده که پس از انجام مراحل لازم در مقیاس آزمایشگاهی محقق گردید.
مواد و روشها: روشها شامل کشت سلول، استخراج RNA، ساخت cDNA، تکنیکهای کلونسازی، القای بیان با IPTG (ایزوپروپیلتیوگالاکتوزیداز)، ارزیابی بیان بهوسیلهی ژل پلیاکریلآمید و تایید توسط وسترن بلات بود.
نتایج: ژن میدکاین در pET-21a(+) کلون و سپس به اوریگامی منتقل شد. این فاکتور رشد در کلونی حاوی pET-21a(+) نوترکیب پس از 16 ساعت انکوباسیون در دمای 18 درجه سانتیگراد با هم زدن در 250 دور در دقیقه، در سطح سیتوپلاسمی بیان گردید. بیان پروتئین 13 کیلودالتونی دارای دم هیستیدینی از طریق وسترن بلات مورد تایید قرار گرفت.
نتیجهگیری: باتوجه به اینکه سویه اوریگامی در ژن های TrxB و gor جهش یافته است، سینوپلاسم محیطی اکسید کننده می باشد، بههمین سبب باعث افزایش تشکیل باندهای دی سولفید میشود. بنابراین بهنظر میرسد که پس از بیان میدکاین، باقی ماندههای سیتوزین بهصورت محلول باقی میمانند. این شرایط باعث بهوجود آمدن محیط مناسبی برای فولدینگ صحیح پروتئین و حل شدن آن میشود.
